Image

Використання послідовностей ДНК для пошуку перспективних штамів гриба-продуцента бета-каротину

Навчальний заклад: Комунальний заклад "Харківська гімназія №6 "Маріїнська гімназія"" Харківської міської ради Харківської області

Автор: Рудавська Поліна Олегівна

Відділення: Екологія та аграрні науки

Секція: Селекція та генетика

Область: Харківська

Опис:

Метою проєкту було за допомогою методів біоінформатики вивчити генетичну спорідненість штамів та ізолятів гриба-продуцента бета-каротину Blakeslea trispora, які розміщені в базах даних біологічної інформації онлайн (NCBI GenBank, EBI ). Вперше було проведено порівняння послідовностей ITS1, ITS2 i гену 5.8S pPHK у 25 колекційних штамів та природних ізолятів B. trispora в програмі Clustal Omega, розміщеної на сайті Європейського Інституту Біоінформатики. Для детального вивчення філогенетичних зв'язків між досліджуваними послідовностями було створено філогенетичне дерево в онлайн-програмі Simple Phylogeny. Аналіз філогенетичного дерева показав, що різні штами та ізоляти B.trispora мають різний ступінь генетичної спорідненості. У подальшій роботі найбільш споріднені штами планується перевірити на продуктивність за бета-каротином, з метою їх подальшого використання в організації біотехнологічного виробництва.